เรื่องราวของ อีธาน ฮันท์ (Tom Cruise) สายลับฝีมือดีที่ถูกตามตัวกลับมาหลังจากหน่วย IMF ระบุว่าเขามีชื่อในการคุ้มกัน ดร. เนโครวิตช์ นักชีวเคมีผู้สร้างไวรัสคิเมียราและยารักษาบิลเลโรฟอน แต่กลับเกิดเหตุเครื่องบินตกเสียชีวิตและไวรัสกับยาถูกขโมยไป IMF เชื่อว่าคนที่เอาไปคือฌอน แอมโบรส ซึ่งเป็นอดีตสายลับ IMF อีธาน ฮันท์ จึงได้รับภารกิจในการยึดไวรัสและยารักษากลับคืนมาโดยเลือกสมาชิกได้เอง 2 คน แต่คนที่ 3 ต้องเป็นไนยาห์ นอร์ดอฟ-ฮอล นักโจรกรรมมืออาชีพที่เข้าถึงตัวแอมโบรสได้เพราะสองคนนี้เคยคบหากันมาก่อน พวกเขาจะต้องบุกเข้าไปในห้องแลปที่ปลอดภัยด้วยการกระโดดออกจากอาคารที่แทบเป็นไปไม่ได้